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Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS)

dc.creatorMalaspinas, Anna Sapfo
dc.creatorTange, Ole
dc.creatorMoreno Mayar, José Víctor
dc.creatorRasmussen, Morten
dc.creatorDeGiorgio, Michael
dc.creatorWang, Yong
dc.creatorValdiosera, Cristina E.
dc.creatorPolitis, Gustavo Gabriel
dc.creatorWillerslev, Eske
dc.creatorNielsen, Rasmus
dc.date2014-10
dc.date.accessioned2022-04-15T01:55:43Z
dc.date.available2022-04-15T01:55:43Z
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11336/136694
dc.identifierMalaspinas, Anna Sapfo; Tange, Ole; Moreno Mayar, José Víctor; Rasmussen, Morten; DeGiorgio, Michael; et al.; Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS); Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 30; 20; 10-2014; 2962-2964
dc.identifier1367-4811
dc.identifierCONICET Digital
dc.identifierCONICET
dc.identifier.urihttp://suquia.ffyh.unc.edu.ar/handle/11336/136694
dc.descriptionSUMMARY: We present bammds, a practical tool that allows visualization of samples sequenced by second-generation sequencing when compared with a reference panel of individuals (usually genotypes) using a multidimensional scaling algorithm. Our tool is aimed at determining the ancestry of unknown samples-typical of ancient DNA data-particularly when only low amounts of data are available for those samples.
dc.descriptionFil: Malaspinas, Anna Sapfo. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.descriptionFil: Tange, Ole. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.descriptionFil: Moreno Mayar, José Víctor. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.descriptionFil: Rasmussen, Morten. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.descriptionFil: DeGiorgio, Michael. Pennsylvania State University; Estados Unidos
dc.descriptionFil: Wang, Yong. University of California; Estados Unidos
dc.descriptionFil: Valdiosera, Cristina E.. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.descriptionFil: Politis, Gustavo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano; Argentina
dc.descriptionFil: Willerslev, Eske. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.descriptionFil: Nielsen, Rasmus. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.languageeng
dc.publisherOxford University Press
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1093/bioinformatics/btu410
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subjectANCESTROS
dc.subjectGENETIC
dc.subjectDNA
dc.subjecthttps://purl.org/becyt/ford/6.1
dc.subjecthttps://purl.org/becyt/ford/6
dc.titleBammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS)
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion


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    Contiene metadatos de artículos publicados en el repositorio CONICET DIGITAL. Unidad Ejecutora: Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano (INCUAPA))

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